Phénofinlait est un programme de recherche et développement de la filière laitière axé autour du phénotypage et génotypage de la composition fine du lait. Il a pour objectif :
     - de déterminer les modalités d'analyse des acides gras et protéines du lait,
     - d'évaluer la part de la génétique et des effets milieux (alimentation) dans l'expression de ces composants,
     - d'enrichir le conseil en élevage sur ces critères.

Clasel est acteur de ce programme. Une information plus complète sur ce dossier vous sera communiquée à l'occasion du prochain Clasel'Info.

Jean-Bernard Davière
Directeur Technique

Thierry BELIER, Administrateur Clasel, Membre de la Commission Technique

Koenraad DUHEM, Directeur scientifique du CNIEL

Philippe BRUNSCHWIG, Institut de l'Elevage

Gérard CHOQUET, Responsable Achats Lait Bel Ouest

témoignent sur ce sujet.

Koenraad DUHEM

Koenraad DUHEM,

C'est quoi PhénoFinlait ?

Les nouveaux outils de génotypage à haut débit et de sélection génomique sont devenus réalité.
En juin dernier sont sortis des index de sélection assistés par marqueurs. Ces index ne couvrent actuellement que des critères phénotypiques classiques relatifs à l'animal plutôt qu'au lait. Jusqu'à présent le phénotypage n'a jamais porté sur des critères très fins, les acides gras plutôt que le taux butyreux ; les protéines spécifiques plutôt que le taux protéique.
Phénofinlait est un grand programme de recherche qui associe le phénotypage sur les caractères fins, le génotypage et des enquêtes en élevage sur une grande échelle.

Quels sont les objectifs de ce programme ?

Le 1er objectif est de créer une grande base de données dont l'analyse permettra d'améliorer les connaissances sur le génotype, l'effet de l'alimentation et les interactions génotype sur le milieu.
Cet ensemble de connaissance permettra de prédire les caractéristiques phénotypiques à partir des génotypes. Ceci ouvre la porte de la sélection génomique sur des caractères fins, jamais imaginé en sélection génétique classique.
Le second objectif est de pouvoir mieux qualifier le lait pour répondre à l'évolution de la demande. Cela passe par la maîtrise du levier génétique et alimentaire pour adapter le lait aux types de destinations.

Qui participe ?

Phénofinlait est un programme ambitieux qui s'appuie sur des collaborations multidisciplinaires.
La motivation étant partagée et les objectifs communs, y participent : l'Interprofession Laitière (CNIEL), l'Interprofession Génétique (FGE), France Contrôle Laitier (dont CLASEL), les coopératives d'insémination artificielle
(UNCEIA), l'INRA, l'Institut de l'Elevage, les laboratoires d'analyses (ANALIS, LABOGENA)... et bien sûr, avec la participation des éleveurs volontaires.

Philippe BRUNSCHWING

Philippe BRUNSCHWIG,

Concrètement, ça consiste en quoi ?

Le programme PhénoFinLait est divisé en 3 étapes :
La 1e correspond à la mise au point des méthodes d'analyses à haut débit des composants fins du lait.
La 2e comprend la collecte des échantillons et l'enquête en élevage sur l'alimentation du troupeau. À l'échelle nationale, plus de 20 000 femelles sont concernées (12000 vaches, 4000 brebis, 4000 chèvres) dans près de 1500 élevages répartis dans 26 départements.
La 3e étape étant la valorisation des données.

Quels sont les résultats attendus ?

Nos attentes sont les suivantes :

- la prédiction des principaux acides gras du lait et de ratios d'intérêt nutritionnel à partir des spectres obtenus par une méthode d'analyses en routine dans le proche infrarouge,
- une meilleure compréhension des équilibres du lait et de l'impact de l'alimentation,
- la création de références pour la sélection génomique,
- l'enrichissement des conseils en élevage pour optimiser les ressources disponibles sur l'exploitation.

Dans combien de temps ?

En 2010, le programme entre dans l'étape 2, c'est-à-dire dans la phase de collecte des échantillons et des enquêtes en élevages lors de 6 contrôles officiels. Ensuite viendra le temps de l'analyse des données combinant les aspects génétiques et d'alimentation. Enfin l'élaboration d'une méthode de conseil en élevage s'appuyant sur les résultats obtenus (2012).

Gérard CHOQUET

Gérard CHOQUET,

Quelles sont les attentes de la filière sur le sujet ?

Les pouvoirs publics ont mis en place des politiques nutritionnelles visant à assurer la bonne santé des consommateurs par une bonne alimentation. En France, il s'agit notamment du Plan National Nutrition Santé (PNNS). Les industriels de l'agroalimentaire, y compris ceux du secteur laitier, doivent tenir compte de recommandations nutritionnelles dans la formulation de leurs produits.
Par ailleurs, depuis quelques années, le lait et les produits laitiers sont l'objet d'attaques, notamment en raison de la composition en acides gras de leur matière grasse.
Les différents acteurs de la filière laitière ont décidé de coopérer pour répondre aux enjeux de la réhabilitation et de la valorisation du lait et des produits laitiers. Le programme Phénofinlait est né pour y répondre.
Dans cette optique d'optimisation de la composition nutritionnelle des laits et de leurs dérivés, l'objectif de Phénofinlait est une meilleure connaissance et compréhension des facteurs qui jouent sur la variation de la composition, notamment la matière grasse, liés à la génétique, à l'alimentation et à leurs interactions.

Quels sont les enjeux pour les laiteries ?

Ceci permettra de répondre aux recommandations des professionnels de santé, aux besoins du consommateur, mais également à réhabiliter l'image santé du lait et des produits laitiers. L'objectif est de leur redonner toute la place qu'ils méritent dans l'alimentation quotidienne des Français.
Tout l'enjeu pour les transformateurs est, par une meilleure maîtrise de la composition du lait, de pouvoir proposer des produits de bonne valeur nutritionnelle, bénéfiques à la santé. Cela passe notamment par l'obtention d'un meilleur profil en acides gras.
Les résultats de ce programme devraient ainsi permettre aux transformateurs français de conserver leur position d'excellence dans un contexte de forte concurrence internationale.

Thierry BELIER

Thierry BELIER,

Quelle est l'implication de Clasel sur le dossier ?

Sont concernés par l'étude Phénofinlait 117 élevages - 1292 vaches en Mayenne et 84 élevages - 1087 vaches en Sarthe.
Les conseillers, formés pour l'occasion en Octobre informent actuellement les éleveurs concernés et recueillent les
signatures de contrats.
La phase de collecte des échantillons et d'enquête en élevage débute en Décembre 2009/Janvier 2010 et se terminera en Juin/Juillet 2010.
Les échantillons de la zone Clasel ainsi que des départements du Maine et Loire et Loire-Atlantique seront analysés à Analis, notre outil d'analyse de la filière laitière.

Quelles sont les attentes des professionnels ?

Quels accompagnements en terme de service aux éleveurs ?

Nous espérons au travers des analyses :
- pouvoir déterminer de nouveaux indicateurs de pilotage du troupeau,
- par la meilleure compréhension des équilibres du lait, enrichir le conseil en élevage,
- être acteur de la sélection génomique en particulier de la voie femelle.

L'avis de l'expert

Phénofinlait est un dossier stratégique pour Clasel puisqu'il concerne ses coeurs de métiers que sont l'analyse du lait, la fourniture d'indicateurs en vue de la sélection génétique et le conseil en élevage. C'est donc naturellement que Clasel s'investit dans ce programme de recherche et développement.

La sélection des élevages s'est faite sur une pré-liste d'exploitations ayant au moins 10 vaches Phénofinlait, proposée par l'INRA, l'UNCEIA et l'Institut de l'élevage.

Le choix des femelles Phénofinlait a été réalisé sur ascendance paternelle avec pour volonté de caractériser au minimum 15 pères par race (Prim'Holstein, Normande, Montbéliard) issues de lignées différentes afin de disposer de la plus grande variabilité possible. Les femelles Phénofinlait sont des vaches en 1ère voire 2e lactation.

Le planning des opérations de collecte comporte 6 contrôles Phénofinlait, 3 en période hivernale, 3 en période estivale, définis par le conseiller hors période de transition alimentaire.

À l'issue de chaque contrôle Phénofinlait est réalisée une enquête en élevage afin de connaître dans le détail l'alimentation du troupeau et en particulier celle des femelles Phénofinlait, l'objectif étant de pouvoir expliquer les variations de composition fine du lait par les facteurs génétiques et de milieu.

Ce dossier présente également des perspectives intéressantes en terme de santé animale notamment par la création de nouveaux indicateurs pour la détection précoce des mammites, de l'acidose, de l'acétonémie...

Jean-Bernard Davière,
Directeur Technique Clasel

LEXIQUE :

• Phénofinlait : phénotypage et génotypage pour la compréhension et la maîtrise de la composition fine du lait.
• Composition fine : composition en acide gras et protéines.
• Génotype : séquence qui caractérise le génome d'un individu.
• Génotypage : analyse ou « lecture » de l'ADN des individus.
• Phénotype : caractère résultant de l'expression du génome dans un milieu donné, ici ce sont les caractères liés à la composition fine du lait.
• Phénotypage : collecte de données pour identifier le phénotype qui nous intéresse, ici estimation de la composition fine du lait.